研究报告

参薯 GRAS 基因家族的挖掘与特征分析  

张娇娇 , 王丹丹 , 聂子页 , 张博 , 夏薇*
海南大学热带作物学院, 海口, 570228
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2021年01月15日    接受日期: 2021年01月22日    发表日期: 2022年02月07日
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摘要

参薯属于薯蓣科薯蓣属,是热带地区重要的粮食作物,具有很高的营养价值。GRAS 基因是一类重要转录因子,在植物的生长和发育中起关键作用。本研究从参薯基因组鉴定 75 GRAS 基因,通过多序列比对结果和系统进化树构建,将参薯 GRAS 家族蛋白划分为 7 亚家族,其中属于 LISCL 亚家族基因最多。分析 DaGRAS 保守 motif 发现,同一亚家族的 GRAS 蛋白具有更相似的 motif 结构、特征。根据参薯叶、块茎、零余子和花序组织转录谱数据分析 GRAS 基因的表达量,发现大比例基因表达量低,DaGRAS18DaGRAS53等基因表达具有组织特异性。RT-qPCR 实验表明 DaGRAS9 基因在块茎中高表达,其结果与转录谱数据一致,该基因的转录自激活实验表明该基因有转录活性。本研究对参薯 DaGRAS 家族进行初步分析,为以后DaGRAS 家族的基因功能验证打下基础。

关键词
参薯;GRAS 基因家族;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
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